急性腎小管腎炎通過(guò)病理檢查往往會(huì)表現(xiàn)為間質(zhì)彌漫性的炎性細(xì)胞浸潤(rùn)伴有間質(zhì)水腫。藥物所導(dǎo)致的急性腎小管腎炎，往往進(jìn)入細(xì)胞呈片狀分布，病變初期主要位于皮髓質(zhì)的交界處。嚴(yán)重的急性腎小管腎炎，可以見(jiàn)彌漫分布，浸潤(rùn)細(xì)胞主要是T細(xì)胞、單核細(xì)胞、巨噬細(xì)胞，會(huì)伴有漿細(xì)胞、嗜酸細(xì)胞以及中性粒細(xì)胞。
一些特殊的病例中在間質(zhì)或者破壞的小管周圍可以見(jiàn)到肉芽腫樣病變。不同原因?qū)е碌募毙蚤g質(zhì)性腎炎浸潤(rùn)細(xì)胞的種類有所差別。慢性腎小管腎炎在病理表現(xiàn)上，光鏡下會(huì)呈現(xiàn)出多灶性或大片狀的纖維化，伴有淋巴細(xì)胞以及單核細(xì)胞浸潤(rùn)腎小管萎縮變性，管腔擴(kuò)大，腎小管基膜肥厚，腎小球出現(xiàn)缺血性硬化，小動(dòng)脈和系動(dòng)脈內(nèi)膜有不同程度的增厚，狹窄甚至閉塞，但是沒(méi)有血管炎的表現(xiàn)，免疫熒光檢查陰性，電鏡檢查往往也沒(méi)有特殊表現(xiàn)。
