新冠疫苗發燒39度沒有嚴重后果，打完新冠疫苗發燒39度可能是打完疫苗后的不良反應，但也不排除是病理因素導致的，比如細菌性感冒、病毒性感冒等。
1、不良反應：在打完打完新冠疫苗后由于疫苗刺激機體的免疫系統可能會產生不良反應，從而引起發熱的癥狀，部分患者可能還會出現關節疼痛、昏睡等癥狀，一般這是在打完疫苗后的不良反應，在經過一段時間的休息后，這種癥狀會逐漸減退。
2、病理因素：
細菌性感冒：在打完打完新冠疫苗后部分患者可能身體抵抗力會比較差，當受到細菌侵害后，就會引起細菌性感冒。患者通常會出現發熱的癥狀，同時并伴有咽喉腫痛、咳嗽、打噴嚏、流膿涕、咳痰等。如果患者病情特別嚴重可以在打完打完新冠疫苗24小時后在醫生的指導下口服抗生素藥物進行治療，比如頭孢克肟膠囊、阿莫西林膠囊等。
病毒性感冒：在打完打完新冠疫苗后部分患者身體抵抗力會比較差，如果在這時受到病毒的侵害，就會引起病毒性感冒。患者通常會出現發熱的癥狀，同時并伴有打噴嚏、鼻塞、流鼻涕等。如果患者病情特別嚴重可以在打完打完新冠疫苗24小時后在醫生的指導下口服抗病毒藥物進行治療，比如利巴韋林顆粒、阿昔洛韋顆粒等。
在治療期間一定要多喝水，對病情恢復可以起到輔助作用。
