第一是陰莖黑色素沉著癥，在臨床上比較少見。長期有龜頭和陰莖體部，表現為色素沉著的斑疹，邊界不清楚，那么這是良性病變。但要通過組織病理學，要與惡性做鑒別。
第二是陰莖海綿狀血管瘤，就是龜頭上有大小不等的青紫色或紫藍色的結節狀團塊，特點是壓著褪色，一松手迅速復原。還有鮑恩樣丘疹病，這是個皮膚病。就是陰莖皮膚多發性的扁平的丘疹，病灶是有兩三個毫米，大的可以到兩三個厘米，大小不等，那么可以伴有色素沉著，呈淡褐色或深褐色。那么小的病灶可以融合成大的病灶，那么這個診斷也需要活檢來證實。這個病組織學上像是原位癌，但實際上它始終都是一個良性的進展過程。
第三是鮑溫病，就是陰莖體上，單個的暗紅色的斑塊，部分區域可以有滲出、結痂，可以表現為油狀、結節狀，那么它可以伴有色素沉著。那么這個實際上就是就是陰莖癌的一個臨床表現一類，臨床表現就是陰莖癌的原位癌。
第四是藥物性的包皮龜頭炎，開始是紅色的斑片，然后變成紫斑，然后就是變成了紫黑色的色素沉著。
第五是壞疽性龜頭炎，那么這個就是臨床比較少見。先是有局部的血液循環障礙，繼發感染，那么這樣就出現局部皮膚的壞死，而變黑。常常見于一些糖尿病、免疫缺陷病、年老體弱的一些患者。表現為一個就是疼痛性潰瘍，質地比較硬，那么機體組織是肉芽組織，一碰就容易出血，表面層壞死組織發黑，甚至皮膚周圍也是呈暗黑色的一些表現。
第六是陰莖癌，陰莖癌持續生長以后，它可以阻止血液的回流，還有阻止血液的供應，造成局部的血液供應障礙，造成局部的壞死和潰瘍，也表現為一個龜頭發黑。
第七是物理的照射，那么常常會伴有色素沉著，也會表現為龜頭發黑。
