乙肝相關性腎炎的病理改變以膜性腎病為特征,膜增生性腎小球腎炎是次常見的病理改變,其它病理類型少見,非典型膜性腎病,乙肝相關性腎炎的膜性腎病的病理特征與原發的膜性腎病不同,為非典型膜性腎病,常伴有一定程度的系膜增生。
內皮細胞增生和腎小球內浸潤細胞增多,使復合物常廣泛沉積于腎小球上皮側,系膜區也可以沉積于內皮下,除C3,IGG沉積以外,也常有IGM,IGA沉積,可出現滿堂亮現象,呈顆粒樣沉積巖,毛細血管袢分布,也可見于系膜區,單純從光鏡下有時難以與狼瘡性腎炎相區分,電鏡下如見到病毒顆粒則支持乙肝相關性腎炎的診斷。