對于膽管癌的病理分型大致分為大體部位的分型和導管癌的組織學的分型,對于大體部分的分型在解剖學上要根據癌發生的部位分為肝內膽管癌、肝門區膽管癌和肝外膽管癌。
膽管癌的組織學類型,其中90%是腺癌,根據癌細胞的類型分化程度及組織生長方式可分為以下六型:乳頭狀腺癌、高分化腺癌、低分化腺癌、未分化腺癌、印戒細胞癌和鱗狀細胞癌。
對于肝內膽管癌的轉移,已肝內轉移為主,常常合并為門脈癌栓,肝外癌膽管發生轉移主要是沿膽管壁向上向下浸潤,直接擴散,肛門部位的淋巴結和腹腔其他部位的淋巴結轉移,血行轉移可見于比較晚的時期,一般比較少見。