強直性脊柱炎晚期往往會出現關節間隙的狹窄、強直和畸形,這是導致本病致殘的主要原因。到了晚期患者如果出現了髖關節間隙的明顯狹窄、股骨頭壞死和變形,如果為了改善患者的關節功能和生活質量,要通過外科手術治療,比如行人工全髖關節置換術,置換術后絕大多數患者的關節痛能夠得到控制。部分患者的功能恢復正常或者接近正常,置入關節的壽命90%可達十年以上。
對于脊柱前屈或側彎畸形較為嚴重的,如果導致明顯的生活功能障礙,要考慮手術糾正治療,比如患者行走的時候無法看到前方幾米外的路,這時候患者要考慮脊柱椎體截骨糾正畸形,但是手術風險比較大,有可能是脊髓受損而導致下肢癱瘓,在手術進行矯正以后,也需要在內科積極治療。