甲減的患者可影響妊娠早期胎兒腦部發育,還有整個妊娠期的神經認知的發育,這個都是可以受到甲狀腺激素水平影響的,與碘缺乏相關的甲狀腺功能減退癥可影響母親和胎兒,但是妊娠期確定并治療的與碘缺乏無關的輕度甲狀腺功能減退癥是沒有相同的影響的。
有的研究表明,沒有治療的甲狀腺功能減退癥與嬰兒智商評分下降有關,這種下降和母體的促甲狀腺激素升高一致,如輕度升高伴有少量下降,沒有檢測到甲狀腺激素治療對女性的影響。
有的研究也表明在十三周的時候,懷孕十三周的時候治療tsh輕度升高,對于智商評分沒有影響,盡管目前絕大多數指南沒有推薦做篩查,但是還是建議在妊娠前進行篩查甲狀腺功能的異。