腦炎的癥狀主要就是全身毒血癥狀以及神經系統癥狀,全身毒血癥狀包括發熱,頭痛,肌肉酸痛,惡心嘔吐,乏力,少數患者會有出血疹以及心肌炎表現,神經系統癥狀方面,患者會有意識障礙,腦膜刺激征,可出現頸肌以及肩胛肌弛緩性的癱瘓,會導致頭下垂,手臂不能夠上舉,會出現無力,癱瘓2到3周。大部分能夠恢復,約半數會有肌肉的萎縮,輕的沒有明顯的神經癥狀。
由于病變的部位以及病變程度輕重不等,所以臨床表現多種多樣。彌漫性腦炎一般常有全身不適,很快出現昏迷,驚厥,同時伴有發熱。腦半球腦炎常有面神經癱瘓,嗆咳,吞咽困難,肢體麻木無力,可能會出現假性球麻痹表現。假性腫瘤性腦炎患者往往會有頭痛,嘔吐,癱瘓,失語,顱內壓增高的表現。另外腮腺炎病毒性腦炎往往伴有腮腺腫大,皰疹性病毒性腦炎會有皮膚的皰疹,柯薩奇的病毒引起的腦炎有可能會出現心肌炎,手足口病。