一般肛瘺這種疾病吃藥只能暫時的緩解癥狀,可以口服的消炎類藥物有頭孢類或者左氧氟沙星片、替硝唑片等,肛瘺不能自愈,必須通過手術進行治療,手術治療的原則是將瘺管全部進行切開,必要時將瘺管周圍的斑痕組織同時切除,使傷口自基地向上愈合。
根據瘺管可選用掛線療法,肛瘺切開或者切除術,手術可行肛瘺的切除后一期進行縫合或者游離植皮,可以使用掛線療法,掛線療法是一種將瘺管緩慢的切開法,然后用橡皮筋或者藥線的機械作用,使結扎處的組織發生血運障礙逐漸壓迫壞死的點,同時結扎的線可作為瘺管的引流物,使瘺道內的滲液排出,防止急性感染的發生。
在表面組織切割的過程中積極的瘡面同時開始逐漸的愈合,切割瘺道的方法最大的優點是肛管的括約肌雖被切斷,但不至于括約肌收縮過多而改變位置,一般不會造成肛門的失禁情況。