慢性腎盂腎炎常見于女性,由于女性尿道相對較短,細菌較容易上行。有些患者在兒童時期有急性尿路感染史,經治療以后癥狀消失,但仍然擔心有無癥狀菌尿,成人后逐漸進展為慢性腎盂腎炎,有時急性腎盂腎炎治愈以后,行尿道器械檢查或插管以后而再次發生感染。
尿路梗阻,比如出現尿路結石,腫瘤,尿道狹窄,女性膀胱頸梗阻等,使患者出現尿流不暢,細菌不易排出而大量繁殖,易引起急性腎盂腎炎反復急性發作,斑痕形成以及腎功能損害,尿路存在功能缺陷和畸形,都是容易導致慢性腎盂腎炎發生。慢性腎盂腎炎最常見的致病細菌仍然為大腸埃希桿菌,但耐藥性較強,包括對喹諾酮類抗生素耐藥。