主要的癥狀為疼痛,典型的癥狀為繼發性的痛經,進行性加重,疼痛多位于下腹部腰骶部以及盆腔的中部,有時候可以放射到會陰部肛門以及大腿常常與月經來潮時出現,并且可以持續到整個的經期。
疼痛嚴重的程度與病灶的大小不一定成正比,粘連比較嚴重的卵巢異位囊腫患者可能并沒有明顯的疼痛,而盆腔內的小的病灶,卻可以引起難以忍受的疼痛。
少數的患者可以表現為持續性的下腹痛,經期加劇,大約有百分之27到40%的患者沒有痛經,一次的痛經的不是內證診斷的必須的癥狀。
還有部分患者就是癥狀表現為月經異常,經量增多經期延長或者是月經淋淋不盡,或者輕度點擊的出血可能與卵巢實質實質改變,然后沒有排卵黃體功能不足或者是合并有子宮腺疾病以及子宮肌瘤有關。