慢性腎盂腎炎主要是以抗感染治療,對于反復發作者強調治療前應通過尿細菌培養確定病原菌以明確是復發或再感染,若治療菌尿轉陰停藥后六周內再次出現同一種細菌的感染為復發,而再感染是另一個新的致病菌侵入引起的感染。
抗生素的選擇可以根據病情,尿細菌培養和藥物敏感實驗結果來選擇以選擇最有效且毒性小者常用的藥物有頭孢菌素類、半合成青霉素類、喹諾酮類,磺胺類,可以采用兩種藥物聯合使用的方法,療程至少維持兩到三周,但用藥三到五日癥狀無改善應考慮換用其他抗生素也可以依據藥物敏感試驗結果將四種抗生素分為兩組輪流使用,每組使用一個療程,停藥一周再開始下一組藥物治療。