?慢性腎盂腎炎的病理特點是腎組織活動性炎癥與修復纖維化瘢痕形成的綜合改變,因病情和病程不同,病變可累及一側或雙側腎臟。雙側腎臟損傷程度可不相同,病變分布也不均勻,呈不規則灶性、多灶性或片狀。
大體解剖可見腎包膜蒼白,不易剝脫,腎外表因瘢痕收縮而凹凸不平,腎盂及腎盞生長擴大,腎盂腎盞粘膜及輸尿管管壁增厚,皮質及乳頭處瘢痕形成,腎髓質變性,皮質與髓質分界不清,嚴重者腎實質廣泛萎縮。
光鏡下腎間質可見淋巴細胞、單核細胞浸潤,急性發作期還可見到中性粒細胞浸潤,伴不同程度腎間質纖維化,伴腎小管萎縮和消失,管腔內充盈膿稠蛋白管型,有時管腔內尚可見白細胞,早期腎小球相對正常,晚期出現腎小球荒廢。