反應性關節炎有些時候雖然具有自限性,在發病后的六周到八個月內,大多數患者可以癥狀完全緩解,外周關節完全恢復,皮膚粘膜的損害也不留痕跡,但就是有一部分患者,會演變為慢性復發性關節炎,一直反復遷延不愈,最終可能會導致關節畸形,甚至合并視力的下降。
而有些慢性的反應性關節炎,可以逐漸演變為其它的脊柱關節病,比如強直性脊柱炎、銀屑病關節炎,或者是腸病性關節炎,這種情況下患者就需要堅持服用藥物治療。
常用的藥物治療包括非甾體類抗炎藥物,通常包括吲哚美辛、雙氯芬酸鈉、布洛芬等,主要是用來緩解關節的腫脹、疼痛癥狀;第二類就是抗風濕改變病情的藥物,它通常包括硫氮磺吡啶以及甲氨蝶呤這兩種藥物。