?主要的不良反應會引起胃腸道的不適,這與阻止攝入脂肪吸收的藥理作用有關,很常見的不良反應為油性斑點、胃腸排氣增多、大便有緊急感、脂肪性大便、脂肪瀉、大便次數增多和大便失禁,隨膳食中脂肪成分的增加,上述不良反應的發生率也相應增高。
改善飲食結構尤其是脂肪含量的控制抑制,低脂飲食可以減少發生胃腸道不良反應的可能性,這些胃腸道不良反應通常是輕度和異過性的,他們在治療早期出現,大部分只出現一時期的不良反應,也有胃腸道的急性反應,比如腹痛、胃腸脹氣、水樣便、軟便、牙齒不適、牙齦不適。
其他少見的不良事件有上呼吸道感染、下呼吸道感染、流行性感冒、頭痛、月經不調、焦慮疲勞、尿道的感染,極少數也有出現大皰疹,還轉氨酶和堿性磷酸酶的升高以及罕見的肝炎等病例的報道,另外也有聯合服用奧利司他和康寧的會產生有凝血酶的減少。