首先通過切斷糞便致口的傳播途徑來預防腹瀉,旅行者應該注意避免食用除水果和蔬菜以外的生食,也不要飲用非瓶裝的飲料或者是未經消毒滅菌的奶制品。
到霍亂流行地區的旅行者要注意飲用水需要經過氯或碘處理,并且濾過或煮沸消毒。即將居住于偏僻地區的旅行者,需要自帶清潔的瓶裝水,預防性使用抗菌藥物是有效的,但是通常不推薦使用。對于存在基礎病的患者,由于腹瀉或嚴重脫水造成的并發癥可能會給患者帶來的風險,超過預防用藥可能的風險時可以預防性應用。
預防性應用的抗菌藥物包括堿式碳酸鉍,可有效用于七天以上旅行的預防腹瀉。調節腸道菌群的制劑可以降低旅行者腹瀉的發生率,也可以酌情接種預防傳染病的疫苗。