口腔扁平苔蘚有可能是感染因素導致的,病毒感染可能是致病的因素之一,但是并沒有任何的充分證據能夠完全證明哪一種具體的病毒能夠引起口腔扁平苔蘚。國內有學者提出過口腔扁平苔蘚的發病與幽門螺桿菌感染有關系,但是并沒有抗幽門螺桿菌治療后,口腔扁平苔蘚治療就有效的這種報道。但是幽門螺桿菌在人群中感染比較廣泛,亞型也比較多,所以還需要進一步的觀察。
也有一些學者用實驗室的方法發現,口腔扁平苔蘚的患者外周血中丙型肝炎RNA較對照組顯著提高,所以認為口腔扁平苔蘚與丙型肝炎病毒有一定的關系,但是還需要進一步的觀察證明。