對于甲狀腺惡性腫瘤的鑒別診斷來說,首先需要和甲狀腺部位的其他良性腫瘤性疾病作鑒別。如位于患者甲狀腺部位的腺瘤以及部分患者出現甲狀腺部位的結節樣改變,需要考慮進行甲狀腺部位的彈性彩超檢查,通過彈性彩超檢查,判斷患者結節的邊界是否清楚,另外結節的彈性評分是多少。對于部分患者,如果結節的邊界清楚,彈性評分在四級以下,多考慮為良性結節的可能,建議繼續的予以觀察。如果其彈性評分在四級以上,邊界不清,需要考慮在超聲引導下,做結節部位的穿刺活檢,通過穿刺活檢,予以病理診斷確診。
另外患者還需要和頸部的淋巴結腫大,以及甲狀舌骨囊腫等疾病予以鑒別診斷。這種情況下,甲狀腺部位的腫瘤會隨著吞咽動作上下活動,但是對于頸部的淋巴結腫大來說,一般不會隨著吞咽動作而活動,必要的情況下,予以頸部的核磁共振檢查。