第一、標本采集,涂片和培養,與結核分枝桿菌相同,標本可以為痰液,體液,膿液,支氣管灌洗液,標本穿刺液和血液等。涂片,抗酸染色,推薦使用熒光染色,敏感性的是碳酸品紅染色膏,培養建議同時使用液體和固體培養基,來自皮膚,關節和骨骼的標本需要含特殊成分的培養基和特殊的培養條件,需要同時在28℃,37℃和42℃進行孵育。
第二,菌種鑒定,可以使用傳統的生化法,并根據它生長的條件,菌落形態,顏色,生長速度等進行鑒定,但是耗時比較長,有些菌種間無法鑒別。
目前,更準確和快速的方法有高效液相色譜法,DNA探針,聚合酶鏈反應,限制性核酸酰胺酶技術,DNA測序,凝膠電泳等。