腱鞘囊腫的治療包括手術治療和非手術治療,其中少數的腱鞘囊腫患者可以自行的消退,但也有部分患者經多種方法治療仍然反復發作,非手術治療保守治療復發率相對較高,但此類方法創傷最小易于被患者接受,臨床上可作為首選的治療方法。可通過擠壓使腱鞘囊腫破裂逐漸自行吸收,但是治療后可能會復發,與關節腔相通的不容易破裂,可以采用穿刺方法抽出囊液,然后加壓按揉或將囊液抽出后輸入腎上腺皮質激素局部加壓包扎,通常會有一定的療效。
手術治療是在其他治療方法無效的時候,可以進行手術切除腱鞘囊腫,但是仍然有一定復發的幾率,因此手術后需要避免患病部位的關節繼續反復的持續活動以及劇烈的活動,以防止再次復發的可能。